Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Akap4Q60662 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Akap4Q60662 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Akap4Q60662 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms