Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mybpc2Q5XKE0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mybpc2Q5XKE0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mybpc2Q5XKE0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mybpc2Q5XKE0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mybpc2Q5XKE0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mybpc2Q5XKE0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mybpc2Q5XKE0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mybpc2Q5XKE0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mybpc2Q5XKE0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mybpc2Q5XKE0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms