Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdcp1Q5U462 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdcp1Q5U462 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdcp1Q5U462 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms