Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp78Q5U406 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp78Q5U406 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms