Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med13Q5SWW4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med13Q5SWW4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms