Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tsr1Q5SWD9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsr1Q5SWD9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsr1Q5SWD9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms