Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ssh2Q5SW75 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ssh2Q5SW75 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ssh2Q5SW75 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh2Q5SW75 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh2Q5SW75 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms