Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc42Q5SV66 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc42Q5SV66 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms