Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd40Q5SUE8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ankrd40Q5SUE8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd40Q5SUE8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms