Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d1Q5SSN7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sft2d1Q5SSN7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms