Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam46cQ5SSF7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fam46cQ5SSF7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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