Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps54Q5SPW0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps54Q5SPW0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms