Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtp3Q5QGU6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtp3Q5QGU6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms