Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim58Q5NCC9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim58Q5NCC9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim58Q5NCC9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms