Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CoblQ5NBX1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CoblQ5NBX1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms