Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd1Q5M956 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd1Q5M956 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms