Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clhc1Q5M6W3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clhc1Q5M6W3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clhc1Q5M6W3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clhc1Q5M6W3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clhc1Q5M6W3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clhc1Q5M6W3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clhc1Q5M6W3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clhc1Q5M6W3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms