Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SynaQ5G5D5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SynaQ5G5D5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SynaQ5G5D5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SynaQ5G5D5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SynaQ5G5D5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SynaQ5G5D5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms