Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5EBG8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5EBG8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q5EBG8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q5EBG8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms