Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nlrc3Q5DU56 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Nlrc3Q5DU56 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Nlrc3Q5DU56 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Nlrc3Q5DU56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrc3Q5DU56 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms