Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GpkowQ56A08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GpkowQ56A08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GpkowQ56A08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GpkowQ56A08 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GpkowQ56A08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GpkowQ56A08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GpkowQ56A08 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GpkowQ56A08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms