Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxf3Q4ZGD9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxf3Q4ZGD9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms