Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM5

Miga1, Mitoguardin 1, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Miga1Q4QQM5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Miga1Q4QQM5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Miga1Q4QQM5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Miga1Q4QQM5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Miga1Q4QQM5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Miga1Q4QQM5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Miga1Q4QQM5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Miga1Q4QQM5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Miga1Q4QQM5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms