Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc27a5Q4LDG0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc27a5Q4LDG0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms