Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf38aQ4FK66 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf38aQ4FK66 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms