Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc110Q3V125 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc110Q3V125 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms