Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Pls1Q3V0K9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls1Q3V0K9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls1Q3V0K9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls1Q3V0K9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pls1Q3V0K9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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Pls1Q3V0K9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls1Q3V0K9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Pls1Q3V0K9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls1Q3V0K9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls1Q3V0K9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pls1Q3V0K9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Pls1Q3V0K9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Pls1Q3V0K9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Pls1Q3V0K9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Pls1Q3V0K9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pls1Q3V0K9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pls1Q3V0K9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pls1Q3V0K9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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