Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930596D02RikQ3V0H9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms