Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp48Q3V0C5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp48Q3V0C5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms