Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnpc3Q3UZ01 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rnpc3Q3UZ01 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnpc3Q3UZ01 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms