Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncbp1Q3UYV9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncbp1Q3UYV9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms