Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc160Q3UYG1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc160Q3UYG1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms