Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
B230104I21RikQ3USW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B230104I21RikQ3USW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
B230104I21RikQ3USW4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms