Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28047Q3US59 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm28047Q3US59 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28047Q3US59 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms