Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vwa5b2Q3UR50 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms