Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tfcp2l1Q3UNW5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tfcp2l1Q3UNW5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2l1Q3UNW5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2l1Q3UNW5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2l1Q3UNW5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2l1Q3UNW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2l1Q3UNW5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2l1Q3UNW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tfcp2l1Q3UNW5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms