Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrch2Q3UMG5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrch2Q3UMG5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms