Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg7Q3ULF4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spg7Q3ULF4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg7Q3ULF4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms