Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Arfgef3Q3UGY8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms