Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trafd1Q3UDK1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trafd1Q3UDK1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms