Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc9Q3U0M1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc9Q3U0M1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms