Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hace1Q3U0D9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms