Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc28Q3TX51 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms