Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pbxip1Q3TVI8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pbxip1Q3TVI8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pbxip1Q3TVI8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms