Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms