Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc2Q3SXD3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms