Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Treml4Q3LRV9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Treml4Q3LRV9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms