Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Riiad1Q3KNY5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms