Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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H2-M3Q31093 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M3Q31093 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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