Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tdrd9Q14BI7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tdrd9Q14BI7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tdrd9Q14BI7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
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